原稿をテキスト形式で扱うことが真に大事かどうかはよく分からない。CLIで処理できればバイナリだろうが問題ない気はする。Gitで取り扱うにしたって、テキストのマージは所詮ベストエフォートなのだし、シリアライズできればAIはどうとでも処理してくれると思います。
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漢字以外のスクリプトでも言語差・地域差に起因するUnificationの問題はいくらかあるんですけどね。
ラテン文字でも、ポーランド語のkreskaやピンインの第二声の記号はacuteに統合されていますが、字形は微妙に違います。（画像の出典：
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