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Human Microbiome Research laboratory of @FollowDbtNibmg has sequenced the whole genome of Rothia amarae, isolated from human skin. Genome sequencing highlights the importance of understanding the genomic and functional aspects of skin microbiome in maintaining skin health. #ODOG# #genomics# #skinhealth# @DrJitendraSingh @rajesh_gokhale
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Rothia santali sp. nov., strain AR01^T, was isolated from the hypocotyl tissue of a sandalwood (Santalum album L.) seedling exhibiting stunted and abnormal growth. The sample was collected from an insect-free sandalwood nursery at the Indian Wood Science and Technology (IWST) institute in Bangalore, India. The endophytic bacterium suggests potential roles in promoting plant growth, enhancing stress resistance, or providing biocontrol against pathogens. #ODOG# #Genomics# @DrJitendraSingh @rajesh_gokhale
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Natronococcus pandeyae sp. nov., was isolated from the lake sediment of Sambhar Salt Lake, Rajasthan, India by @DBT_NCCS_Pune. The extreme halophilicity and alkaliphilicity of Natronococcus pandeyae suggests applications in #biotechnology# and #environmental# conservation. Its enzymes may be harnessed for #industrial# processes requiring stability under high salt and alkaline conditions, such as in #bioremediation# of saline-alkaline environments or the production of compatible solutes for stress protection in crops. #ODOG# #Genomics# @DrJitendraSingh @rajesh_gokhale
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Alkalihalobacterium chitinilyticum sp. nov., was isolated from sediment collected from Lonar Lake, India by @DBT_NCCS_Pune. The ability to degrade complex polysaccharides positions it as a promising candidate for #biotechnological# applications, including chitin #wastetreatment# and biocontrol of phytopathogens. The production of alkaline-stable lipases and proteases suggests use in detergent formulations and other industrial processes requiring #enzymes# that function in high pH environments. #ODOG# #Genomics# @DrJitendraSingh @rajesh_gokhale
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Human Microbiome Research laboratory of @FollowDbtNibmg has sequenced the whole genome of Stutzerimonas stutzeri, isolated from human skin, promotes skin health. Genome sequencing highlights the importance of understanding the genomic and functional aspects of S. stutzeri. #ODOG# #genomics# #skinhealth# @DrJitendraSingh @rajesh_gokhale
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Human Microbiome Research laboratory of @FollowDbtNibmg has sequenced the whole genome of Staphylococcus warneri, isolated from human skin, promotes skin health. Genome sequencing highlights the importance of understanding the genomic and functional aspects of S. warneri in maintaining skin health. #ODOG# #Genomics# #skinhealth# @DrJitendraSingh @rajesh_gokhale
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Pseudomonas phenolilytica sp. nov. represents a step forward in sustainable waste management and bioremediation efforts, promising a cleaner and greener future. From tackling toxic pollutants to supporting global health initiatives, this novel species symbolizes innovation at the intersection of microbiology and environmental stewardship. #ODOG# #Genomics# #Greengrowth# #Gogreen# #Biomanufacturing# @DrJitendraSingh @rajesh_gokhale @bric_ils
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Halopseudomonas maritima sp. nov., a novel aerobic bacterial species isolated from sea sand by @bric_ils . Most notably, this species produces a lipase enzyme of the α/β hydrolase family, exhibiting structural homology to lactonizing lipases. This unique enzyme has significant potential for industrial applications, particularly in biocatalysis and sustainable manufacturing. #ODOG# #Genomics# @DrJitendraSingh @rajesh_gokhale
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Glutamicibacter mishrai sp. nov., a remarkable addition to marine #microbiology#. This novel actinobacterium, isolated by @bric_ils from the coral Favia veroni in the Andaman Sea, India, stands as a testament to the diversity and potential of marine ecosystems. Named in honour of the esteemed late Professor Ajit K. Mishra of the Bose Institute, Calcutta, India, a distinguished microbiologist, this discovery pays homage to his enduring legacy in advancing microbiological #research#. #ODOG# #Genomics# #Marine# @DrJitendraSingh @rajesh_gokhale
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如何分析AI生物制药领域公司的竞争优势?这里是我研究的核心要点总结: 1. 核心驱动力:“闭环”飞轮效应是真正的护城河 在AI驱动的生物制药赛道中,真正的护城河并非仅仅拥有先进的AI算法,而是建立一个高效、快速迭代的“闭环”飞轮。这个飞轮的具体运作模式是:AI模型(干实验室/Dry Lab)进行预测,例如识别新的药物靶点或设计新的分子;然后,自动化机器人(湿实验室/Wet Lab)快速进行生物实验以验证这些预测;实验产生的高质量、独家的(Proprietary)数据被立即反馈给AI模型,用于下一轮的训练和优化。这个“设计-制造-测试-学习”(DMTA)的循环速度和规模,决定了公司的核心竞争力。像Recursion每周能进行超过200万次自动化实验,其数据飞轮转速极快,使其能够以前所未有的速度绘制“生物学地图”。这种模式下,数据优势增强了模型能力,而更强的模型能指导公司进行更精准的实验,从而获得更优质的数据,形成一个不断自我加强、竞争对手难以逾越的壁垒。 2. AI原生生物科技(AI-Native Biotech):“速度与平台”的双重革命 以Recursion、Exscientia和Insilico Medicine为代表的AI原生公司是这场革命的先锋。它们的共同特点是,从零开始就将AI和自动化实验深度整合,构建了端到端的药物发现平台。Recursion的“Recursion OS”通过对细胞进行大规模扰动和表型成像,建立了一个庞大的、可用于导航的生物学地图,其核心是规模化的数据生成能力。Exscientia则强调“以患者为先”,利用源于真实患者组织的多组学数据来指导AI模型,使其预测更具临床相关性,并已成功将多个AI设计的候选药物推入临床。Insilico Medicine则以其Pharma. AI平台闻名,该平台包括用于靶点发现的PandaOmics和用于分子设计的Chemistry42,并以惊人的速度将其首个AI发现和设计的药物从概念阶段推进到临床II期。这些公司不仅通过技术平台吸引了与大型药企数十亿美元的合作,也同时在建立自己的内部药物管线,展示了“平台即产品”的强大商业模式。 3. 传统大型药企(Big Pharma)的觉醒:“数据金矿”与“生态系统”的构建 传统大型药企如赛诺菲(Sanofi)已经意识到,它们最大的资产之一是沉睡了几十年的海量专有临床前和临床数据。它们的策略是“双管齐下”:一方面,大规模投资内部AI平台,如赛诺菲的plai,旨在打通从研发到生产、商业化的所有数据孤岛,赋能内部科学家;另一方面,它们不再仅仅是技术购买方,而是与顶尖AI公司(如与Exscientia合作)甚至科技巨头(如与OpenAI合作)建立深度战略合作,用自己高质量的专有数据来“精调”(Fine-tune)最前沿的AI大模型。这种策略的优势在于,它们拥有验证AI预测结果的完整后端能力——从临床前开发到全球临床试验再到市场准入。大型药企的飞轮在于其数据的广度和深度,以及将AI模型洞见转化为上市药物的强大能力,这是初创公司在短期内无法比拟的。 4. 技术平台公司(Tech Platform)的降维打击:从“卖铲子”到“共同掘金” 这一类别的公司以薛定谔(Schrödinger)和Isomorphic Labs (Google DeepMind)为代表。薛定谔的独特之处在于其基于物理学的计算平台与机器学习的深度融合。它开创了一种混合商业模式:既通过向全球药企销售其业界领先的模拟软件来获得稳定、高利润的现金流(“卖铲子”),又利用这个平台进行内部药物研发和与大药企(如BMS)的高价值合作(“共同掘金”),分享后期收益。这种模式风险较低,且能通过广泛的客户使用和合作项目不断验证和改进其平台。而Isomorphic Labs则代表了另一种力量,它继承了Google DeepMind在AlphaFold上的突破性成就,试图用最纯粹的“AI优先”或“数字生物学”方法重新定义整个药物发现过程。它不依赖于自己的湿实验室,而是相信其强大的预测和生成模型本身就构成了核心价值,通过与大型药企(如礼来、诺华)建立价值数十亿美元的里程碑式合作,来验证其“数字孪生”驱动的研发模式。 5. 数据护城河的两种主要形态:规模化工业数据 vs. 精准化人类数据 在AI制药领域,数据是核心资产,但其形态和获取方式决定了护城河的类型。第一种是“规模化工业数据”,以Recursion为典范。通过在实验室中对标准化细胞模型进行数百万次可控的实验扰动(如基因编辑、化合物处理),生成海量、统一、高质量的图像和组学数据。这种数据的优势在于其规模和一致性,适合训练能够理解复杂生物学通路的底层模型。第二种是“精准化人类数据”,以Exscientia和Verge Genomics等公司为代表。它们专注于获取与特定疾病直接相关的真实人类生物样本(如肿瘤活检、神经退行性疾病的脑组织),并进行深度多组学分析。这种数据的优势在于其极高的临床相关性,能够帮助AI模型更准确地识别与人类疾病真正相关的靶点和生物标志物。这两种数据策略各有千秋,未来最强大的公司可能会是能将两者有效结合的企业。 6. 商业模式的演进:从单一服务到“合作+自有管线”的双轮驱动 早期AI制药公司多以提供技术服务或点状合作为主,但现在赛道领先者已经普遍进化为“合作+自有管线”的双轮驱动模式。这种模式的好处是多方面的:首先,通过与大型药企的高价值合作,不仅可以获得大量非稀释性的资金来支持平台发展,还能借助合作伙伴的专业知识和资源来验证其平台的技术价值和商业潜力,这本身就是一种强有力的背书。其次,建立内部药物管线,尤其是将候选药物推进到临床阶段,是证明其平台能够独立创造最终产品(药物)的终极证据。这不仅能带来未来更高的潜在回报(如果药物成功上市),也极大提升了公司在合作谈判中的议价能力和整体估值。Insilico Medicine拥有超过30个内部管线项目,其中多个已进入临床,充分展示了这种策略的执行力。 7. 行业面临的共同挑战:从数据孤岛到“可解释性AI” 尽管前景光明,但整个行业仍面临严峻挑战。首先是“数据挑战”,包括数据孤岛(数据分散在不同部门、格式不一)、数据质量参差不齐,以及公开数据与能用于训练强大模型的专有数据之间的巨大鸿沟。其次是“模型挑战”,特别是“黑箱问题”。AI模型,尤其是深度学习模型,其决策过程往往不透明,这在受到严格监管、人命关天的制药行业中是重大障碍。因此,“可解释性AI”(XAI)的发展至关重要,科学家和监管机构需要理解模型做出某个预测的生物学依据,才能真正信任并采纳其结果。最后是“验证挑战”,一个AI预测出的新靶点或新分子,最终仍需通过耗时且昂贵的真实世界实验和临床试验来验证,这个“从虚拟到现实”的转化瓶颈依然存在,是衡量一个AI制药公司成熟度的关键指标。 8. 未来趋势展望:生成式AI与多模态数据的融合 展望未来,两个关键趋势将主导AI制药的发展。第一是“生成式AI的深化应用”。继AlphaFold在蛋白质结构预测领域取得突破后,生成式AI正被广泛用于从头设计全新的蛋白质、抗体和具有理想特性的小分子药物,这远比在现有化学库中进行筛选更具想象空间。这意味着AI的角色正在从“发现者”转变为“创造者”。第二是“多模态数据的融合”。未来的AI模型将不再仅仅依赖于基因组或蛋白质组数据,而是能够同时理解和整合来自不同维度的数据类型,如基因组学、转录组学、蛋白质组学、细胞成像数据、电子病历(EHR)和数字病理学图像等。通过构建一个更全面的疾病数字孪生模型,AI将能更精准地进行个性化治疗方案推荐、预测药物反应和临床试验结果,真正将精准医疗推向一个新的高度。
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Moraxella tetraodonis sp. nov. (strain PS-22) isolated from Tetraodon cutcutia skin shows potential for exploring glutathione metabolic pathways. With genes linked to nitrogen and organic substance metabolism, this novel bacterium could provide new insights into antioxidant roles and microbial functions in aquatic environments. @DrJitendraSingh @rajesh_gokhale #Microbiology# #Bacteriology# #GlutathioneMetabolism# #AquaticMicrobes# #GenomicResearch#
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