说真的,
Hy4 preview
@TencentHunyuan
这次帮了我大忙。
单位这边,要做 GPCR 配体筛选。
很多候选分子是亲脂的,
真正进口袋之前
先在磷脂双层里分区、侧向扩散
膜的厚度、面积、尾链有序性也会把受体的构象平衡往一边推。单纯做分子对接一套,膜里又是另一套。
所以磷脂双分子层建模本身就得先跑稳、跑够长,后面才谈得上把受体嵌进去筛。
问题是单位不让用海外模型。
自己反复推,
热路径改完不是对不齐,就是快不了
3万多原子的磷脂双层,
SO3LR 机器学习力场,
底下已经是一份抠过很久的 JAX 实现
再往上挤怎么都没戏。
换成 Hy4 preview,这条才走通。
在目前基线上又快 2倍,
到 54.9 ms/step
这次是真帮我踩着ddl算过去了
真!救我狗命!