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宝玉
@dotey
AI Engineer, dedicated to learning and disseminating knowledge about AI, software engineering, and engineering management.
加入 April 2007
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Claude 在噬菌体里发现类 CRISPR 新酶系统 Anthropic 宣布,Claude 在噬菌体(专门感染细菌的病毒)的 DNA 中发现了一类此前没人注意到的酶系统。它的结构特征和 CRISPR 很像,Anthropic 将其命名为 ART,意思是"阵列相关逆转录酶"。 逆转录酶的作用是把 RNA 抄写成 DNA。ART 由三部分组成:一个逆转录酶,旁边一个功能未知的搭档基因,以及一长串等间距排列的重复 DNA 序列。CRISPR 也有类似的重复阵列,里面存着"导航信息",所以 CRISPR 可以被编程,去基因组的指定位置剪切。实验已经证实,ART 的阵列同样会被转录成一组各不相同的短 RNA,这暗示它可能也有类似的可编程机制。 这个发现值得关注,是因为同时具备这几项特征的系统,以前只找到过寥寥几个,而且全都能对 DNA 做剪切、复制、粘贴之类的操作。CRISPR 已经催生了基因编辑药物,另外几个也正在被开发成新工具。不过 Anthropic 也承认,ART 的具体功能目前还不清楚。 整个发现过程几乎由 Claude 独立完成。研究人员只给了一个初始提示,让它在海量 DNA 数据库里寻找有意思的新逆转录酶。大约 950 个 Claude 智能体跑了 21 小时,消耗 2.1 亿 token。它们从 20 多万个逆转录酶中筛出 3500 个候选,再挑出最值得看的 20 个,写成人类能读懂的报告。 其中一个智能体在逐段读原始序列时,直接认出了重复阵列。接着它数了重复次数,量了间距,和已知系统做比对,又查了文献,确认是新东西之后才提交给人类审核。这个逆转录酶本身以前有人报道过,但它旁边的阵列和搭档蛋白,是 Claude 第一个发现的。 据 Anthropic 介绍,这类"基因组挖掘"工作,专家通常要花几周到几个月。CRISPR 先驱、MIT 教授张锋看过预印本后评价说,这是 AI 智能体参与生物学发现的一个好例子,这类阵列值得深入研究。 这项成果出自 Anthropic 今年春天新组建的生命科学研究组。团队在湾区建了自己的湿实验室,只做 BSL-1、BSL-2 级别的低风险研究,不接触能感染人的病原体。所有实验都由人类科学家动手完成。 团队日常用的工具是公开发布的 Claude Science 和 Claude Code。这意味着其他实验室理论上也能搭起这套"AI 批量提假设、人做实验验证"的流程。Anthropic 目前正在向外部科学家征集可以合作的研究课题。
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Claude has discovered a previously unknown enzyme system hidden in the DNA of bacteriophages. Beside the enzyme’s gene sits a long array of repeating DNA—a structure that looks somewhat similar to CRISPR. We don’t yet understand what this system does, but only a handful of known systems share its features, and all of them are able to cut, copy, and paste DNA. Historically, the discovery of such programmable systems has helped revolutionize medicine. CRISPR, for instance, is now the foundation of genetic medicines. But it will take much more work to learn what this system does, and whether it can be put to similar use. Read more:
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