很多人误以为黑死病只肆虐了欧洲，主要是因为欧洲留下了大量关于黑死病的系统性医学记载、文学作品，比如《十日谈》和震撼的骷髅绘画。 而当时中国正处于元朝末年的极端混乱期，群雄割据、战乱不断，许多地方志将瘟疫与饥荒、战争混在一起记录，导致其在历史叙事中被战争掩盖了。 事实上，14世纪的那场全球鼠疫大流行，对中国造成了极为深重的灾难。 现代人口史学家和基因生物学研究表明，在1330年到1390年之间（即元末明初），中国的人口经历了毁灭性的下降。 据《元史》等文献记载，早在1331年的欧洲黑死病爆发前十几年，中国北方就爆发了极为严重的恶性传染病，记录称“死者十四五”，甚至有记载称部分疫区“九成人口死亡”。 在公元1200年左右，中国本部及周边区域的总人口超过1亿。而到了明朝开国初期的户口普查（约1393年），全国登记人口仅剩约6000多万。虽然其中包含战争和饥荒的因素，但鼠疫在其中的致死权重极大。 基因测序表明，14世纪的鼠疫杆菌有着共同的亚洲源头。病毒沿着丝绸之路和海运商路向西扩散，在1346年蔓延至黑海的卡法城，随后通过热那亚商人的船只彻底引爆了欧洲的黑死病。 而根据Nature发布的古 DNA 2022年研究结果，14 世纪黑死病的源头被证实位于中亚的吉尔吉斯斯坦。那里是天山山脉山脚下的伊塞克湖附近，在 14 世纪，曾是古丝绸之路上的重要贸易枢纽。 科学家提取了当地两处 1338–1339 年间墓地遗骸的牙齿 DNA。在死者的牙齿残存物中，成功分离出了最原始的鼠疫杆菌株。 基因谱系显示，这个地点的病毒正是后来引发全球黑死病大爆炸的祖先母体菌株。研究发现，该菌株与当地天山山脉野生旱獭身上携带的现代鼠疫细菌关系最为密切，证明当时是人类通过捕猎或接触野生旱獭。